陽離子聚丙烯酰胺的毒性情況較為復雜，需要綜合多方面因素來判斷，具體如下：

聚合物本身：完整聚合狀態下的陽離子聚丙烯酰胺本身基本無毒或低毒。它在進入人體后，絕大部分會在短期內排出體外，很少被消化道吸收。多數商品對皮膚也無刺激，只有某些水解體因有殘余堿，在反復、長期接觸時會有刺激性。

殘留單體：聚丙烯酰胺的單體丙烯酰胺是有毒的，被國際癌癥研究機構（IARC）分類為對人類有致癌性的 2A 類物質。不過，正規生產的陽離子聚丙烯酰胺產品，在生產過程中會通過嚴格的聚合反應控制，使未反應的丙烯酰胺單體含量盡量降低，一般要求殘留單體含量低于安全標準，如國際標準要求殘留單體含量不超過 0.05%。在遵循安全操作和環保標準的前提下，陽離子聚丙烯酰胺在工業應用中是相對安全的。

引入基團：陽離子聚丙烯酰胺引入的氨基類等基團，其毒性往往數十至數百倍地高于陰離子聚丙烯酰胺和非離子聚丙烯酰胺，它們的慢性毒性還在進一步研究中。

雖然陽離子聚丙烯酰胺在正常使用條件下對人體健康風險相對較低，但在使用和處理過程中，仍需遵循適當的安全操作規程，如佩戴防護裝備、避免直接皮膚接觸和吸入粉塵等，以保障人員健康和環境保護。